Несмотря на определённые военные успехи ВС и МВД России, итогами этого конфликта стали поражение и вывод федеральных войск, массовые разрушения и жертвы, де-факто независимость Чечни до второго чеченского конфликта и волна террора, прокатившаяся по России.

В сентябре 1991 года люди Дудаева разгромили в Грозном Верховный Совет ЧИАССР. Депутатов избивали и выбрасывали из окон, в результате погиб председатель горсовета Виталий Куценко. Председатель Верховного Совета РСФСР Руслан Хасбулатов после этого отправил им телеграмму «С удовольствием узнал об отставке ВС республики». После распада СССР Джохар Дудаев объявил о выходе Чечни из состава Российской Федерации и о создании Республики Ичкерии.

И даже после этого, когда Дудаев прекратил платить налоги в общий бюджет и запретил сотрудникам российских спецслужб въезд в республику, федеральный центр официально продолжал перечислять Дудаеву деньги. В 1993 году на Калининградскую область было выделено 140 млн рублей, на Чечню 10,5 млрд рублей.

Российская нефть до 1994 года продолжала поступать в Чечню. Дудаев за неё не платил, а перепродавал за рубеж. Также Дудаеву досталось много оружия: 2 пусковые ракетные установки сухопутных войск, 42 танка, 34 БМП, 14 БТР, 14 легкобронированных тягача, 260 самолётов, 57 тысяч единиц стрелкового автоматического оружия и много другой военной амуниции.
В это время в Чечне шёл неприкрытый геноцид русских.

С лета 1994 года в Чечне развернулись боевые действия между верными Дудаеву правительственными войсками и силами оппозиционного Временного совета. 26 ноября оппозиционеры безуспешно штурмовали Грозный. При этом в плен к сторонникам Дудаева попал ряд российских военнослужащих, сражавшихся на стороне оппозиции по контракту с Федеральной службой контрразведки.

11 декабря 1994 года подразделения Минобороны и МВД России вошли на территорию Чечни на основании указа Президента РФ Бориса Ельцина «О мерах по пресечению деятельности незаконных вооружённых формирований на территории Чеченской Республики и в зоне осетино-ингушского конфликта».
31 декабря 1994 — февраль 1995 — Битва за Грозный.
7 января — в горных районах Чечни окружены силами противника и сдались в плен 48 военнослужащих 22-й отдельной бригады спецназа ГРУ[7].
10 марта — начало боёв за Бамут
7 апреля — бой за село Самашки. Потери российской стороны составили 13—16 человек погибшими и 50—52 — ранеными. Особую обеспокоенность правозащитных организаций вызвала зачистка села после боя, в результате которой, по непроверенным данным, погибло свыше 100 мирных жителей.[8].
10 апреля — федеральные силы с минимальными потерями заняли Ачхой-Мартан
15-17 апреля — безуспешная попытка штурма Бамута
3 июня — федеральные силы вошли в Ведено
12 июня — федеральные силы овладели населенными пунктами Шатой и Ножай-Юрт
14-17 июня — террористический акт в Будённовске
6 октября — в Грозном произошло покушение на командующего федеральной группировкой войск генерал-лейтенанта Анатолия Романова. Генерал получил тяжёлые травмы и в течение многих лет после покушения находился в коме.
14 декабря — боевики Руслана Гелаева захватили Урус-Мартан, но позже отступили
15 декабря — боевики Салмана Радуева отбили Гудермес, но позже также отступили
9 января — рейд на Кизляр (Салман Радуев)
6—8 марта — рейд боевиков на Грозный[9].
15 апреля — начат вывод федеральных войск из Чечни[10].
16 апреля — в Аргунском ущелье у села Ярышмарды попала в засаду и понесла тяжёлые потери колонна федеральных войск.
21 апреля — Джохар Дудаев погиб от удара ракеты в районе села Гехи-чу, в 30 км от Грозного.
22 мая — взятие Бамута.
28 мая — незадолго до президентских выборов Борис Ельцин посетил с визитом Чечню. Выступая перед военнослужащими федеральных войск, он заявил: «Война окончилась. Победа за вами. Вы победили мятежный дудаевский режим».
6 августа — операция «Джихад», в ходе которой чеченские боевики восстанавливают контроль над Грозным, федеральные силы в Гудермесе и Аргуне также блокированы боевиками. Фактически это означало разгром федеральных войск.
14 августа — соглашение о прекращении огня.
31 августа года принимаются Хасавюртовские соглашения, подписанные Асланом Масхадовым и Александром Лебедем, рассматриваемые многими сторонниками целостности РФ как предательские. Начинается вывод федеральных войск из Чечни.

Командующие Объединённой группировкой федеральных сил в Чеченской Республике

Митюхин, Алексей Николаевич (декабрь 1994)
Квашнин, Анатолий Васильевич (декабрь 1994 — февраль 1995)
Куликов, Анатолий Сергеевич (февраль — июль 1995)
Романов, Анатолий Александрович (июль — октябрь 1995)
Шкирко, Анатолий Афанасьевич (октябрь — декабрь 1995)
Тихомиров, Вячеслав Валентинович (январь — октябрь 1996)
Пуликовский, Константин Борисович (и.о. июль — август 1996)