Как и его предшественник Hearts of Iron I, игра была запрещена в Китайской народной республике. Основным камнем преткновения является то, что игра изображает различные китайские провинции в качестве независимых субъектов, а по данным правительства КНР, они номинально являлись частью Китайской Республики, представленных в игре как «Националистический Китай». Кроме того, тибетский флаг использованный в игре, запрещен в Китае. Paradox заявил, что оно не приведет к снижению уровня исторической точности, чтобы успокоить КНР цензурой.

Германия представлена с флагом немецкой империи, который использовался в Германии до 1935 года, а не флаг свастика, как это было сделано ранее в настольную игру Axis & Allies. Законы в Германии запрещают использование свастики. Дополнительно в немецкой версии игры фотографии ведущих нацистских лидеров, таких как Гитлер, Геринг и Гиммлер были удалены, и впоследствии их имена изменены, хотя это и не требуется в соответствии с немецким законодательством. Фотографии и флаги в игре могут быть легко изменены пользователем, но Paradox запрещает обсуждение данного конкретного вида изменений на доске объявлений.