Причины войны
Причиной войны стал спор между Перу и Эквадором за обладание территориями, большая часть которых лежала в бассейне Амазонки между горной цепью Анд и рекой Мараньон. Начало ему было положено ещё в колониальный период; на протяжении XIX и XX веков произошло несколько военных столкновений между Перу и Великой Колумбией, а после распада Великой Колумбии — между Перу и Эквадором; было предпринято также несколько попыток мирного урегулирования отношений, но положить конец конфликту не удалось.

В 1940 пограничные столкновения участились. 11 января 1941 президент Перу Мануэль Прадо-и-Угартече, утверждая, что эквадорцы вторгаются на перуанскую территорию Сарумилья, приказал начать формирование Северной группировки.

Ход боевых действий
5 июля пограничные столкновения переросли в открытую войну. До сих пор ведутся споры о том, какая сторона первой начала военные действия; по версии перуанцев, эквадорцы вторглись на территорию провинции Сарумилья и открыли огонь по перуанскому патрулю, по версии эквадорского полковника Родригеса, эквадорский патруль обнаружил на эквадорской территории несколько перуанских гражданских лиц и полицейского, который первым открыл огонь и убил одного эквадорца.

Соотношение сил к этому времени было следующим: Эквадор имел 2 батальона, развёрнутых вдоль реки Сарумилья (3 высших офицера, 33 офицера и 743 рядовых), кроме того, в непосредственной близости от места военных действий находились 4 высших офицера, 3 офицера, 28 солдат, 93 добровольца и 500 карабинеров; Перу — от 11 500 до 13 000 человек.

С 5 по 7 июля вдоль высохшего русла Сарумильи велись бои с активным применением артиллерии, а со стороны Перу также авиации, после чего на некоторое время установилось затишье. Это позволило перуанцам приготовиться к решающему наступлению; 23 июля они, используя огромное численное преимущество и закупленные в Чехословакии танки, начали наступление в направлении эквадорского портового города Пуэрто-Боливар, с моря блокированного флотом; одновременно перуанская авиация начала бомбардировки городов Уакильяс, Аренильяс, Санта-Роза и Мачала. 27 июля Пуэрто-Боливар был взят перуанцами с использованием воздушного десанта (это была первая воздушно-десантная операция в Западном полушарии; всего в ней участвовало 30 десантников). После 31 июля боевые действия приняли вялотекущий характер; 21 ноября Перу и Эквадор подписали перемирие.

Итог
По итогам перемирия между Перу и Эквадором, которое 29 января было подтверждено протоколом Рио-де-Жанейро, 278 тысяч км² эквадорской территории в верхнем течении Амазонки переходило к Перу; Аргентина, Бразилия, США и Чили выступили гарантами соблюдения договора. Однако 78-километровый участок границы вдоль реки Сенепа не был демаркирован в течение 5 лет, что впоследствии дало повод для нового вооружённого конфликта.

В 1960 президент Эквадора Хосе Мария Веласко Ибарра объявил о признании протокола недействительным, так как был подписан во время оокупации эквадорской территории перуанцами. Тем не менее, Перу, Бразилия, Аргентина, Чили и США продолжали считать, что договор в силе. Противостояние Перу и Эквадора ещё два раза выливалось в открытый военный конфликт — в 1981 (война Пакиша) и 1995 (война Альто-Сенепа). Окончательный мир между Перу и Эквадором был заключён только 26 октября 1998 в Бразилиа.